Главный герой мультфильма «Рататуй» - крыса. Зовут его Реми. Он умеет читать, обладает совершенным обонянием и мечтает, что-то изменить в своей жизни. Живет среди крыс, которые только и знают, что лазить по помойкам и питаться отбросами. Он же считает, что «если я - это то, что я ем, то не стану есть мусор». Его семья жила на чердаке в доме у одной старушки. Реми частенько заглядывал к ней на кухню, где прочитал книгу французского кулинара Гюсто «Готовить могут все», и смотрел передачи с его участием. Его слова и вдохновили Реми к экспериментам с едой, ему захотелось оставить после себя след тем, что он умел готовить новыми блюдами.

Отец Реми - глава их клана, никогда ничему не удивляется и не придает значения способностям сына. Брат Эмиль, его же напротив очень легко удивить, всегда поддерживал Реми. С ним он мог быть самим собой. Именно вместе с ним, он делает первые пробы в приготовлении блюд, правда это не совсем хорошо закончилось: их застала хозяйка дома, с чего и начались приключения Реми. Их семье пришлось поспешно бежать. Реми ни в коем случае не хотелось бросать книгу, и он отстает от всех и они теряют друг друга. Оказавшись в одиночестве и считая, что он навсегда потерял своих близких, вдруг неожиданно для себя начинает разговаривать со своим вторым «я». В мультфильме оно изображено духом шеф-повара Гюсто, который и направляет его. Так главный герой попадает в ресторан Гюсто. После смерти шеф-повара в ресторане хозяйничает его заместитель – Живодер. Он использует образ Гюсто и продает замороженные полуфабрикаты, из-за чего, ресторан превратился в забегаловку. На кухне ресторана работает единственная девушка повар – Колет. Добиться этой должности ей стоило многих усилий, «так как высокая кухня закостенела в жестоких рамках поставленных глупыми стариками».

Одновременно с Реми в ресторане появляется Альфредо Лингвини, как позже выяснится сын покойного кулинара Гюсто. Парень неуклюжий, никак не может найти работу. Ресторан для него последняя надежда. Здесь его берут уборщиком. Но он в первый же день умудряется опрокинуть кастрюлю с супом, потом пытается это исправить, а в итоге только портит все. Ему на помощь приходит наш маленький друг Реми и исправляет суп. Так происходит знакомство Лингвини и Реми. Они понимают, что по одному им не справится, но как же быть. Счастливая случайность подсказывает им решение. Они вместе начинают учиться, создают что-то новое, чем получают всеобщее признание.